La richesse du site s'apprécie au travers du nombre et de la diversité des habitats naturels qui y évoluent.
7 habitats sont d'intérêt communautaire :
Landes à myrtilles et callunes (6.56 ha soit 3% des sites N2000 Sucs Velay-Meygal)
Les landes sont un élément structurant du site des Sucs du Velay-Meygal.
Les landes sèches abritent un cortège floristique typique. Ces milieux ouverts abritent une faune variée, notamment des oiseaux de proie.
Deux espèces subalpines d'intérêt patrimonial sont présentes : le raisin des ours protégé au niveau régional et le lycopode sélagine.
Menaces : piétinement par la divagation touristique et la colonisation par des boisements périphériques
Quelques actions de gestion :canaliser la fréquentation touristique, suivi de la colonisation des ligneux, intégration du N2000 dans le schéma d'accueil, etc.
Landes à genêt purgatif (0.31 ha soit 0.1% des sites N2000)
Cet habitat est présent sur les abrupts rocheux de versant, des sommets ou des corniches.
Le sol est généralement squelettique à bilan hydrique très déficitaire.
Le Genêt purgatif est largement dominant, accompagné d'espèces plus ou moins héliophiles.
Cet habitat est certainement une zone de refuge pour la faune.
Menaces : dégradations liées au piétinement touristique
Quelques actions de gestion : limiter la divagation touristisque, intégration du N2000 dans le schéma d'accueil
Lande à Juniperus communis forme rampante (15.58 ha soit 7% des sites N2000)
Cet habitat montagnard est dominé par le genévrier plus ou moins rampant.
Localisée sur les pentes et les corniches, c'est un élément paysager des sucs.
Trois espèces remarquables sont présentes dans cet habitat : l'Allosore crépue, l'Amélanchier, Le Leucanthème de Montpellier.
Menaces : des plaques d'érosion ont été observées
Quelques actions de gestion : suivi des plaques d'érosion
Mégaphorbiaies montagnardes et subalpines à Clamagrostide roseau (0.15 ha soit 0.01% des sites N2000)
Entre 1 200 m et 1750 m d'altitude, cet habitat évolue sur des pentes généralement fortes d'éboulis fixés, extrasylvatiques, ensoleillées.
La végétation élevée (plus 1m de hauteur) est dominée par le Calamagrostide roseau.
La présence d'espèces végétales patrimoniales a été observée : le Lis martagon, l'Alisier de Mougeot, le Doronic d'Autriche.
Menaces : fermeture par le boisement spontané, disparition des espèces végétales patrimoniales
Quelques actions de gestion : suivi de la colonisation par les ligneux, suivi des espèces végétales patrimoniales
Hêtraies acides atlantiques montagnardes (4.09 ha soit 2% des sites N2000)
Ces forêts acidiphiles sont présentes sur les pentes, au pied des sucs. Elles sont une unité relique des hêtraies du Velay.
Normalement le sapin et le hêtre sont co-dominants mais le site présente, parfois, un faciès à hêtre seul.
On retrouve de l'Alisier blanc, du sorbier des oiseleurs, du houx sporadiquement.
Menaces : coupes rases et plantation d'essences exotiques, ouverture de pistes forestières
Quelques actions de gestion : gestion jardinatoire arbre par arbres ; une charte a été signée sur certaines hêtraies.
Les éboulis phonolitiques (15.43 ha soit 7% des sites N2000)
Cet habitat est pauvre en espèces bien que deux espèces remarquables sont présentes :
La Marguerite de Montpellier et la Cardamine à feuilles de Réséda. L'épervière ampléxicaule a aussi été observée.
Une mousse, Coscinodon horridus, unique en France a été récemment recencée.
Menaces : érosion locale par divagation touristique
Quelques actions de gestion : limiter la divagation, intégrer le Natura 2000 dans le schéma d'accueil du Meygal
Falaises de phonolite, blocs rocheux élevés (1.24 ha soit 1% des sites N2000)
Les communautés végétales présentes dans cet habitat se développent dans les fissures des parois rocheuses.
Cet habitat abrite deux espèces rares, inscrites sur la liste rouge régionale de la flore menacée :
La Margerite de Montpelier et le Lycopode sélagine.
